불법연구회의 최종 「회규」가 수위단회를 종법사 보좌 기관으로 하고 1개 항의 의결 사항만을 규정한데 대해 「원불교 교헌」은 수위단회를 「종법사의 최고 자문에 응하는 기관」으로 하고 5개 항의 의결 사항을 규정하여 법적으로 수위단회의 기능을 확대하였으며, 사실상 이로 부터 수위단회는 이단치교의 중심이 되기 시작하였다.
초창기 남자 수위단의 첫 조직과 법인 성사의 성취 사실은 이미 기술하였거니와, 원기 11년(1926·丙寅)에 박 세철의 열반으로 이 동안이 입단하고, 이 순순·박 동국·유 건의 대리로 송 도성·전 음광·조 갑종이 내정되었다가 16년(1931·辛未) 2월에 정식 입단하였으며, 그 해 3월에 여자 수위단 시보단이 처음 조직되었으나, 기도 행사 중 뒤로 미루었다. 원기 20년(1935·乙亥)에 김 기천의 열반으로 유 허일, 24년에 김 광선의 열반으로 박 대완, 26년에 이 동안의 열반으로 서 대원(徐大圓), 28년 4월 개편 조단으로 이 완철이 입단하는 동시에, 여자 수위단이 대종사에 의하여 새로 내정되었다. 여자 수위단은, 단장 대종사, 건방(乾方) 일타원 박 사시화(一陀圓朴四時華대리金永信), 감방(坎方) 이타원 장 적조(二陀圓張寂照대리曺專權), 간방(艮方) 삼타원 최 도화(三陀圓崔道華대리曺一貫), 진방(震方) 사타원 이 원화(四陀圓李願華대리徐大仁), 손방(巽方) 오타원 이 청춘(五陀圓李靑春대리吳宗泰), 이방(离方) 육타원 이 동진화(六陀圓李東震華), 곤방(坤方) 칠타원 정 세월(七陀圓鄭世月), 태방(兌方) 팔타원 황 정신행(八陀圓黃淨信行), 중앙(中央) 구타원 이 공주(九陀圓李共珠)였다.
그 해(원기28·1943) 6월, 대종사 열반 후 개편 조단으로 송 혜환, 29년, 이 재철 열반으로 김 대거가 입단하였으며, 30년(1945·乙酉) 1월25일, 여자 수위단이 실무단으로 발족함에 이르러, 5인의 대리 단원이 정식 입단하고, 「남녀 정수위단」이 비로소 「회규」에 따라 실무 체제를 갖추었다. 그 후 31년 4월에 남자 수위단 제 8차 보결 조단이 있었고, 38년(1953·癸巳) 4월에 창립 제 2대를 맞아 첫 총선거로 상당수 남녀 단원의 개편이 이루어 졌다.
39년(1954·甲午) 4월에 정산 종법사는 수위단회와 교무 연합회에 내리신 유시로 「수위단회의 위신과 직능을 더욱 강화하여 교단 통치의 핵심체를 삼으라」 하시었고, 이 뜻은 44년(1959·己亥)의 교헌 개정에 충분히 반영되었다. 54년(1969·己酉) 5월에는 그 동안 총무부가 겸행해 온 수위단회 사무처를 독립 발족(초대처장金允中)하여 분과제와 전문위원제를 실시함으로써 수위단회는 명(名)과 실(實) 함께 교단 최고의 의결 통치 기관이 되었으며, 창립 제2대에 들어서서 반백년 기념대회 연도까지 4차의 총선거와 남녀 각 3차의 보결 조단이 있었다.